Термин образован от греческих корней ‘heis’ / ‘hen-’ (один) и ‘theos’ (бог). Понятие ‘генотеизм’ было введено и популяризировано в XIX веке немецко-британским филологом и религиоведом Максом Мюллером специально для описания древнеиндийской ведийской религии, в которой поклонение одному верховному божеству не отрицало существования других богов. Впоследствии это слово прочно закрепилось в мировом религиоведении и стало применяться для характеристики переходных систем верований древних цивилизаций Индии, Египта, Ближнего Востока и античного Средиземноморья.